Le palmarès du Football Club de Nantes est le quatrième de France en nombre de titres de champion de France professionnel remportés (8), derrière l’AS Saint-Étienne et le Paris Saint-Germain avec 10 titres, l’Olympique de Marseille avec 9 titres, ex-aequo avec l’AS Monaco et devant l’Olympique lyonnais, qui a remporté sept titres. Le Paris Saint-Germain termine le championnat à la deuxième place avec 20 victoires, 11 matchs nuls et 7 défaites. Pierre Boya entre en jeu en seconde période tout seul en pointe avec Daniel Moreira en soutien lui aussi entré en lieu et place de Nassim Akrour, il se procure quelques occasions. La seconde période est d’autant plus dominée par le GF38 après le premier quart d’heure mais les Parisiens bien en place n’ont pas cédé. Il échappe de peu à une seconde relégation consécutive la saison suivante mais redresse ensuite la tête et parvient à remporter le tour final provincial en 2006, ce qui lui permet de réintégrer la Promotion. C’était ensuite au tour de Saint-Étienne de se voir refuser un but. Les Isérois tentent d’égaliser mais c’était sans compter sur un Hugo Lloris irréprochable. Cet été-là, un important effort de recrutement permet les arrivées des Argentins Ángel Marcos et Hugo Bargas, élu sportif argentin de l’année la saison précédente, ainsi que de l’Allemand Erich Maas en provenance du Bayern de Munich. Le Bayern Munich est alors l’adversaire contre lequel l’OL va disputer la première demi-finale de son histoire dans la compétition. La première mi-temps débute sur les chapeaux de roues pour le GF38 qui ne sort presque plus de la surface monégasque. La seconde mi-temps resta totalement fermée, chacune des deux formations attendant l’erreur de l’autre.
L’arbitre siffle alors la fin de la seconde période, la prolongation peut alors commencer. 0-0 à la fin des 90 minutes de jeu, l’arbitre peut alors siffler la prolongation. La prolongation n’a rien donné, il faut donc passer à l’épreuve fatale des tirs au but, maillot ajaccio remportée finalement 4-3 par les Grenoblois qui auront tremblé jusqu’au bout. Le début du match est totalement grenoblois. En infériorité numérique, le Dijon FCO aura pourtant une grosse occasion pour égaliser en fin de match, Bruno Ecuele Manga est à la réception d’un ballon dévié et tente une reprise de volée, mais le ballon fracassera la barre. À la 76e la recrue marseillaise Bostjan Cesar inscrit un but de la tête 1-1. Deux minutes plus tard, Sofiane Feghouli se présente face à Ramé et est tout près de donner la victoire au GF38 sur une magnifique frappe qui finit sur la barre transversale. Une superbe reprise de volée d’Akrour sur un centre de Daniel Moreira passera juste au-dessus de la transversale de Nicolas Douchez. Il marque à la 14e minute sur une passe de Laurent Batlles pour Daniel Moreira qui exécute un petit pont sur Ruffier et envoie le ballon au fond des filets. Un penalty indiscutable pour une faute d’Alonzo sur Daniel Moreira n’est pas sifflé pourtant le gardien nantais avait bel et bien les deux pieds décollés du sol. La première période commence bien avec des actions de part et d’autre. Nantes domine la première mi-temps, la défense grenobloise est trop fébrile, à tel point qu’à la 39e minute Ivan Klasnic trouve la faille, 1-0 pour les canaris. Malgré l’absence de leur attaquant vedette Yannick Bolasie les Léopards terminent premiers de leur poule après deux succès 1-0 face au Maroc et 3-1 face au Togo ainsi qu’un match nul 2-2 face à la Côte d’Ivoire.
Cette saison, l’équipe est engagée au sein de la poule A du groupe Grand-Est de la compétition. Les Dijonnais poussent mais Le Crom est impérial ce soir. Après sa qualification en 1/4 de finale de Coupe de France le GF38 doit se remettre dans le bain du championnat et penser au maintien qui se jouera en partie ce soir face à Caen. Hooligans : football, l’état de siège, téléfilm documentaire sur le hooliganisme, centré en partie sur le cas OM-PSG. Mais le Stade des Alpes a très vite déchanté puisque huit minutes plus tard Morgan Amalfitano porte le score à 3-1 et refait le break d’un magnifique lobe sur Grégory Wimbée. Le match débute bien pour les hommes de Mécha Bazdarevic qui avait le ballon et les occasions à leur avantage jusqu’à la demi-heure de jeu où sur un superbe coup franc direct de Kevin Gameiro trompait Grégory Wimbée d’une frappe imparable, 1-0 pour les merlus à 15 minutes de la mi-temps. Les Dijonnais font le pressing et jouent bien au ballon. Les Grenoblois ne se relâchent pas et continuent à bien faire circuler le ballon et jouent à une touche de balle. Une petite équipe certes mais bien regroupée défensivement, les Isérois n’arrivent pas à trouver la faille. Sandy Paillot pour son 4e but de la saison réduisait le score à 2-1 à la 91e. Une défaite qui ne condamne pas le GF38 qui est encore en bonne voie pour le maintien. La seconde mi-temps est cette fois à l’avantage des Grenoblois qui poussent pour tenter d’égaliser mais sur un contre d’Issiar Dia, les Nancéens font le break, 2-0 à la 66e minute de jeu.